Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms