Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR1EP28566 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms