Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PSMB9P28065 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB9P28065 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms