Protein–RNA interactions for Protein: P24666

ACP1, Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACP1P24666 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACP1P24666 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACP1P24666 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACP1P24666 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACP1P24666 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACP1P24666 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACP1P24666 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACP1P24666 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACP1P24666 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACP1P24666 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACP1P24666 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACP1P24666 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACP1P24666 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACP1P24666 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACP1P24666 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACP1P24666 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACP1P24666 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACP1P24666 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACP1P24666 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACP1P24666 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACP1P24666 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACP1P24666 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACP1P24666 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACP1P24666 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACP1P24666 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACP1P24666 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACP1P24666 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACP1P24666 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACP1P24666 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACP1P24666 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACP1P24666 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACP1P24666 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACP1P24666 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACP1P24666 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACP1P24666 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACP1P24666 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACP1P24666 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACP1P24666 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACP1P24666 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACP1P24666 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACP1P24666 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACP1P24666 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACP1P24666 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACP1P24666 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACP1P24666 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACP1P24666 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACP1P24666 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACP1P24666 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACP1P24666 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACP1P24666 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACP1P24666 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACP1P24666 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACP1P24666 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACP1P24666 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACP1P24666 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACP1P24666 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACP1P24666 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACP1P24666 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACP1P24666 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACP1P24666 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACP1P24666 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACP1P24666 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACP1P24666 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACP1P24666 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACP1P24666 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACP1P24666 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACP1P24666 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACP1P24666 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACP1P24666 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACP1P24666 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACP1P24666 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACP1P24666 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACP1P24666 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACP1P24666 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACP1P24666 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACP1P24666 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACP1P24666 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACP1P24666 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACP1P24666 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACP1P24666 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACP1P24666 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACP1P24666 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACP1P24666 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACP1P24666 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACP1P24666 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACP1P24666 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACP1P24666 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACP1P24666 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACP1P24666 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACP1P24666 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACP1P24666 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACP1P24666 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACP1P24666 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACP1P24666 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACP1P24666 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACP1P24666 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACP1P24666 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACP1P24666 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACP1P24666 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACP1P24666 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms