Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP5F1P24539 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5F1P24539 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms