Protein–RNA interactions for Protein: P21926

CD9, CD9 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD9P21926 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD9P21926 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD9P21926 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD9P21926 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD9P21926 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD9P21926 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD9P21926 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD9P21926 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD9P21926 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD9P21926 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD9P21926 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD9P21926 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD9P21926 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD9P21926 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD9P21926 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD9P21926 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD9P21926 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD9P21926 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD9P21926 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD9P21926 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD9P21926 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD9P21926 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD9P21926 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD9P21926 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD9P21926 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD9P21926 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD9P21926 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD9P21926 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD9P21926 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD9P21926 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD9P21926 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD9P21926 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD9P21926 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD9P21926 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD9P21926 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD9P21926 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD9P21926 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD9P21926 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD9P21926 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD9P21926 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD9P21926 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD9P21926 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD9P21926 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD9P21926 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD9P21926 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD9P21926 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD9P21926 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD9P21926 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD9P21926 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD9P21926 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD9P21926 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD9P21926 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CD9P21926 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD9P21926 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD9P21926 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD9P21926 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CD9P21926 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CD9P21926 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD9P21926 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD9P21926 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD9P21926 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD9P21926 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD9P21926 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD9P21926 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD9P21926 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD9P21926 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD9P21926 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD9P21926 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD9P21926 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD9P21926 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD9P21926 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD9P21926 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD9P21926 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD9P21926 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD9P21926 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD9P21926 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD9P21926 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD9P21926 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD9P21926 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD9P21926 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD9P21926 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD9P21926 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD9P21926 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD9P21926 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD9P21926 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD9P21926 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD9P21926 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD9P21926 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD9P21926 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD9P21926 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD9P21926 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD9P21926 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD9P21926 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD9P21926 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD9P21926 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD9P21926 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD9P21926 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD9P21926 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD9P21926 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD9P21926 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms