Protein–RNA interactions for Protein: P20908

COL5A1, Collagen alpha-1(V) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1P20908 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL5A1P20908 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL5A1P20908 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms