Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CTPS1P17812 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTPS1P17812 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms