Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STMN1P16949 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STMN1P16949 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STMN1P16949 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STMN1P16949 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STMN1P16949 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STMN1P16949 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STMN1P16949 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STMN1P16949 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STMN1P16949 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STMN1P16949 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STMN1P16949 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STMN1P16949 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STMN1P16949 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STMN1P16949 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STMN1P16949 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STMN1P16949 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMN1P16949 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STMN1P16949 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMN1P16949 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMN1P16949 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMN1P16949 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STMN1P16949 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STMN1P16949 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STMN1P16949 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STMN1P16949 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STMN1P16949 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STMN1P16949 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STMN1P16949 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STMN1P16949 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STMN1P16949 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STMN1P16949 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STMN1P16949 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STMN1P16949 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STMN1P16949 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMN1P16949 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMN1P16949 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMN1P16949 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMN1P16949 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMN1P16949 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMN1P16949 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMN1P16949 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMN1P16949 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMN1P16949 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMN1P16949 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMN1P16949 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STMN1P16949 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STMN1P16949 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STMN1P16949 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STMN1P16949 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STMN1P16949 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STMN1P16949 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STMN1P16949 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STMN1P16949 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STMN1P16949 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STMN1P16949 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STMN1P16949 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STMN1P16949 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STMN1P16949 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STMN1P16949 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STMN1P16949 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STMN1P16949 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STMN1P16949 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STMN1P16949 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STMN1P16949 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STMN1P16949 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STMN1P16949 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STMN1P16949 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STMN1P16949 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STMN1P16949 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
STMN1P16949 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STMN1P16949 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STMN1P16949 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STMN1P16949 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STMN1P16949 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STMN1P16949 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STMN1P16949 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STMN1P16949 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STMN1P16949 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STMN1P16949 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STMN1P16949 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STMN1P16949 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMN1P16949 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms