Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VEGFAP15692 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VEGFAP15692 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VEGFAP15692 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms