Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMP1P11279 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMP1P11279 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms