Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCF2P10911 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCF2P10911 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCF2P10911 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCF2P10911 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCF2P10911 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCF2P10911 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCF2P10911 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCF2P10911 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCF2P10911 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCF2P10911 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCF2P10911 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2P10911 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2P10911 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2P10911 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2P10911 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2P10911 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2P10911 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2P10911 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2P10911 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCF2P10911 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCF2P10911 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCF2P10911 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCF2P10911 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCF2P10911 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCF2P10911 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCF2P10911 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2P10911 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2P10911 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2P10911 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2P10911 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2P10911 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2P10911 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2P10911 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2P10911 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2P10911 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2P10911 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2P10911 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCF2P10911 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCF2P10911 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCF2P10911 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCF2P10911 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCF2P10911 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCF2P10911 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCF2P10911 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCF2P10911 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCF2P10911 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCF2P10911 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCF2P10911 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCF2P10911 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCF2P10911 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCF2P10911 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCF2P10911 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCF2P10911 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCF2P10911 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCF2P10911 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MCF2P10911 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCF2P10911 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCF2P10911 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCF2P10911 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCF2P10911 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCF2P10911 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCF2P10911 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCF2P10911 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCF2P10911 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCF2P10911 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2P10911 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2P10911 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2P10911 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2P10911 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2P10911 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2P10911 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2P10911 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2P10911 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2P10911 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCF2P10911 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCF2P10911 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCF2P10911 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCF2P10911 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCF2P10911 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCF2P10911 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCF2P10911 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCF2P10911 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCF2P10911 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCF2P10911 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCF2P10911 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCF2P10911 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCF2P10911 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCF2P10911 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCF2P10911 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MCF2P10911 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCF2P10911 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCF2P10911 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCF2P10911 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCF2P10911 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MCF2P10911 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCF2P10911 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCF2P10911 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCF2P10911 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCF2P10911 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms