Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC159P0C7I6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC159P0C7I6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms