Protein–RNA interactions for Protein: P07359

GP1BA, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BAP07359 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GP1BAP07359 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GP1BAP07359 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GP1BAP07359 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms