Protein–RNA interactions for Protein: P05156

CFI, Complement factor I, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFIP05156 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFIP05156 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFIP05156 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFIP05156 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFIP05156 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFIP05156 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFIP05156 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFIP05156 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFIP05156 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFIP05156 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFIP05156 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFIP05156 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFIP05156 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFIP05156 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFIP05156 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFIP05156 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFIP05156 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFIP05156 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFIP05156 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFIP05156 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFIP05156 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFIP05156 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFIP05156 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFIP05156 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFIP05156 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFIP05156 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFIP05156 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFIP05156 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFIP05156 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFIP05156 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFIP05156 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFIP05156 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFIP05156 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFIP05156 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFIP05156 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFIP05156 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFIP05156 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFIP05156 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFIP05156 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFIP05156 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFIP05156 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFIP05156 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFIP05156 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFIP05156 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFIP05156 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFIP05156 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFIP05156 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFIP05156 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFIP05156 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFIP05156 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFIP05156 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFIP05156 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFIP05156 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFIP05156 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFIP05156 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFIP05156 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFIP05156 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFIP05156 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFIP05156 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFIP05156 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFIP05156 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFIP05156 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFIP05156 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFIP05156 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFIP05156 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFIP05156 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFIP05156 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFIP05156 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFIP05156 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFIP05156 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFIP05156 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFIP05156 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFIP05156 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFIP05156 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFIP05156 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFIP05156 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFIP05156 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFIP05156 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFIP05156 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFIP05156 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFIP05156 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFIP05156 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFIP05156 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFIP05156 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms