Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HLA-DQB1P01920 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DQB1P01920 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DQB1P01920 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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