Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
F9P00740 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F9P00740 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
F9P00740 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
F9P00740 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
F9P00740 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F9P00740 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F9P00740 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F9P00740 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F9P00740 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F9P00740 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F9P00740 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F9P00740 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F9P00740 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
F9P00740 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F9P00740 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F9P00740 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F9P00740 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F9P00740 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F9P00740 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F9P00740 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F9P00740 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
F9P00740 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24■■□□□ 1.43
F9P00740 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
F9P00740 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F9P00740 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F9P00740 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
F9P00740 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
F9P00740 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
F9P00740 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
F9P00740 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F9P00740 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
F9P00740 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F9P00740 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F9P00740 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
F9P00740 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
F9P00740 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
F9P00740 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F9P00740 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F9P00740 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
F9P00740 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
F9P00740 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
F9P00740 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F9P00740 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
F9P00740 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
F9P00740 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
F9P00740 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
F9P00740 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
F9P00740 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
F9P00740 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F9P00740 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
F9P00740 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
F9P00740 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F9P00740 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F9P00740 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
F9P00740 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F9P00740 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
F9P00740 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
F9P00740 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
F9P00740 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F9P00740 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F9P00740 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
F9P00740 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
F9P00740 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
F9P00740 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
F9P00740 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
F9P00740 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
F9P00740 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
F9P00740 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
F9P00740 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
F9P00740 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
F9P00740 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
F9P00740 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
F9P00740 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
F9P00740 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
F9P00740 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
F9P00740 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
F9P00740 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
F9P00740 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
F9P00740 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
F9P00740 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
F9P00740 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
F9P00740 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
F9P00740 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
F9P00740 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F9P00740 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F9P00740 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F9P00740 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
F9P00740 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
F9P00740 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
F9P00740 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
F9P00740 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F9P00740 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
F9P00740 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F9P00740 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F9P00740 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
F9P00740 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F9P00740 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F9P00740 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F9P00740 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms