Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTCP00480 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTCP00480 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTCP00480 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTCP00480 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTCP00480 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTCP00480 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTCP00480 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTCP00480 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTCP00480 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTCP00480 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTCP00480 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTCP00480 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTCP00480 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTCP00480 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTCP00480 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTCP00480 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTCP00480 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTCP00480 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTCP00480 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTCP00480 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTCP00480 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTCP00480 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTCP00480 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTCP00480 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTCP00480 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTCP00480 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTCP00480 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTCP00480 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OTCP00480 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTCP00480 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTCP00480 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTCP00480 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTCP00480 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTCP00480 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTCP00480 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTCP00480 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTCP00480 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTCP00480 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTCP00480 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTCP00480 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTCP00480 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTCP00480 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTCP00480 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTCP00480 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTCP00480 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTCP00480 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTCP00480 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTCP00480 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OTCP00480 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTCP00480 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTCP00480 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTCP00480 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTCP00480 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTCP00480 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTCP00480 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTCP00480 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTCP00480 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTCP00480 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTCP00480 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
OTCP00480 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTCP00480 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTCP00480 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTCP00480 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTCP00480 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTCP00480 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTCP00480 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTCP00480 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTCP00480 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OTCP00480 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTCP00480 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTCP00480 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OTCP00480 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTCP00480 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTCP00480 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTCP00480 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTCP00480 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTCP00480 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTCP00480 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTCP00480 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTCP00480 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTCP00480 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTCP00480 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTCP00480 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTCP00480 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTCP00480 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTCP00480 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTCP00480 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTCP00480 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTCP00480 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTCP00480 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTCP00480 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTCP00480 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTCP00480 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTCP00480 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTCP00480 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTCP00480 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTCP00480 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTCP00480 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTCP00480 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms