Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE8BO95263 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE8BO95263 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE8BO95263 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms