Protein–RNA interactions for Protein: O75838

CIB2, Calcium and integrin-binding family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB2O75838 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB2O75838 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB2O75838 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB2O75838 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB2O75838 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB2O75838 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB2O75838 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB2O75838 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB2O75838 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB2O75838 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB2O75838 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB2O75838 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB2O75838 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB2O75838 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB2O75838 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB2O75838 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB2O75838 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB2O75838 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB2O75838 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB2O75838 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB2O75838 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB2O75838 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB2O75838 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB2O75838 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB2O75838 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB2O75838 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB2O75838 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB2O75838 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB2O75838 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB2O75838 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB2O75838 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB2O75838 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB2O75838 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB2O75838 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB2O75838 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB2O75838 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB2O75838 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CIB2O75838 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB2O75838 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB2O75838 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB2O75838 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB2O75838 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB2O75838 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB2O75838 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB2O75838 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB2O75838 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB2O75838 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB2O75838 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB2O75838 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB2O75838 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB2O75838 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB2O75838 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB2O75838 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB2O75838 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB2O75838 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB2O75838 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB2O75838 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB2O75838 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB2O75838 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB2O75838 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB2O75838 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB2O75838 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB2O75838 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB2O75838 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB2O75838 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB2O75838 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB2O75838 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB2O75838 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB2O75838 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB2O75838 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB2O75838 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB2O75838 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB2O75838 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CIB2O75838 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIB2O75838 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIB2O75838 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIB2O75838 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIB2O75838 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIB2O75838 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIB2O75838 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB2O75838 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB2O75838 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB2O75838 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB2O75838 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB2O75838 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB2O75838 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB2O75838 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB2O75838 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CIB2O75838 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CIB2O75838 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB2O75838 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB2O75838 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB2O75838 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB2O75838 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB2O75838 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB2O75838 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB2O75838 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB2O75838 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB2O75838 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB2O75838 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms