Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NPHP4O75161 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NPHP4O75161 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NPHP4O75161 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms