Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTSVO60911 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSVO60911 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSVO60911 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSVO60911 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSVO60911 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSVO60911 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSVO60911 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSVO60911 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSVO60911 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTSVO60911 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSVO60911 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSVO60911 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSVO60911 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSVO60911 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSVO60911 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSVO60911 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTSVO60911 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSVO60911 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSVO60911 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSVO60911 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSVO60911 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSVO60911 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSVO60911 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSVO60911 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSVO60911 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSVO60911 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTSVO60911 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSVO60911 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSVO60911 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSVO60911 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSVO60911 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSVO60911 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSVO60911 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSVO60911 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSVO60911 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSVO60911 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSVO60911 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSVO60911 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSVO60911 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSVO60911 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSVO60911 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTSVO60911 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSVO60911 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSVO60911 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSVO60911 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSVO60911 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTSVO60911 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSVO60911 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSVO60911 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTSVO60911 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSVO60911 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSVO60911 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSVO60911 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSVO60911 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSVO60911 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSVO60911 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSVO60911 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSVO60911 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSVO60911 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSVO60911 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSVO60911 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSVO60911 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSVO60911 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSVO60911 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSVO60911 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSVO60911 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSVO60911 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSVO60911 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSVO60911 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSVO60911 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSVO60911 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSVO60911 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSVO60911 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSVO60911 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSVO60911 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSVO60911 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSVO60911 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSVO60911 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSVO60911 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSVO60911 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSVO60911 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSVO60911 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSVO60911 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSVO60911 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSVO60911 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSVO60911 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSVO60911 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSVO60911 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSVO60911 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSVO60911 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSVO60911 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSVO60911 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms