Protein–RNA interactions for Protein: O60684

KPNA6, Importin subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA6O60684 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KPNA6O60684 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA6O60684 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KPNA6O60684 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms