Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXTL3O43909 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXTL3O43909 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms