Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ACTN4O43707 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTN4O43707 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN4O43707 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms