Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD28O15084 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms