Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCAMP3O14828 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAMP3O14828 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAMP3O14828 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms