Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSP2O14595 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTDSP2O14595 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.7 ms