Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QR89 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QR89 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QR89 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QR89 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QR89 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QR89 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QR89 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QR89 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QR89 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QR89 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QR89 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QR89 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QR89 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QR89 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QR89 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QR89 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QR89 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QR89 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QR89 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QR89 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QR89 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QR89 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QR89 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QR89 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QR89 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QR89 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QR89 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QR89 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QR89 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QR89 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QR89 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QR89 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QR89 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QR89 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QR89 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QR89 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QR89 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QR89 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QR89 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3QR89 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QR89 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QR89 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QR89 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QR89 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QR89 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QR89 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QR89 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QR89 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QR89 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QR89 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QR89 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QR89 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QR89 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QR89 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QR89 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QR89 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QR89 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QR89 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QR89 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QR89 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QR89 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QR89 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QR89 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QR89 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3QR89 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QR89 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QR89 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QR89 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QR89 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QR89 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QR89 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QR89 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QR89 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QR89 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QR89 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QR89 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QR89 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QR89 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QR89 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3QR89 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QR89 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QR89 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3QR89 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms