Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC01387J3KSC0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC01387J3KSC0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms