Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP73A6NFT4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms