Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L4A6NCW7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L4A6NCW7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms