Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC162PA2VCL2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC162PA2VCL2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms