Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLRN2A0PK11 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLRN2A0PK11 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLRN2A0PK11 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 337.7 ms