Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms