Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRIT1Q9P2V4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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LRIT1Q9P2V4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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LRIT1Q9P2V4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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LRIT1Q9P2V4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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