Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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