Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms