Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCC13Q9NSE7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms