Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00597Q9H2U6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms