Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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