Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDGFDQ9GZP0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDGFDQ9GZP0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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