Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIOK2Q9BVS4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms