Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms