Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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