Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms