Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms