Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms