Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.1 ms