Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC84Q86UT8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms