Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms